龙芯笔记本

龙芯笔记本

龙芯既然出了《龙芯应用开发标准教程》何不再出一本类似《intel 微控制器》的书?

issacsonjj 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 54 次浏览 • 2018-12-17 16:01 • 来自相关话题

龙芯电脑推广民用难以一蹴而就,应向苹果学习支持windows双系统

liyongA06 发表了文章 • 5 个评论 • 165 次浏览 • 2018-12-03 09:06 • 来自相关话题

支持windows系统是龙芯电脑走向民用的必然过程,国产系统被民众接受不可能一蹴而就,苹果电脑如果不能支持windows买的人会少很多,多数用户都选择安装双系统。龙芯cpu只支持linux系统,应用生态不完善,所以很难民用。但是电脑可以采用龙芯cpu与x86核 ...查看全部
支持windows系统是龙芯电脑走向民用的必然过程,国产系统被民众接受不可能一蹴而就,苹果电脑如果不能支持windows买的人会少很多,多数用户都选择安装双系统。龙芯cpu只支持linux系统,应用生态不完善,所以很难民用。但是电脑可以采用龙芯cpu与x86核心cpu的组合实现windows系统支持或者是双系统支持,甚至在linux系统中直接安装使用windows系统的程序。双cpu协同工作也为大幅度提高电脑性能提供了可能性。两种不同指令集的cpu协同工作在技术上也许非常困难,是本小白的异想天开而已,但科技发展本就是从异想天开开始。

龙芯多核心CPU可以加入x86cpu的核心,实现linux系统与windows系统切换吗?

jiangtao9999 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 222 次浏览 • 2018-07-11 10:55 • 来自相关话题

建议龙芯笔记本电脑建立全新的软硬件升级模式

start0878 回复了问题 • 2 人关注 • 2 个回复 • 419 次浏览 • 2018-02-27 11:48 • 来自相关话题

请问我在哪里能下载到龙芯服务器历史版本?

paul_lmc 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 293 次浏览 • 2018-01-02 16:48 • 来自相关话题

龙芯生物信息学软件应用测试

zd200572 发表了文章 • 6 个评论 • 405 次浏览 • 2017-10-20 13:20 • 来自相关话题

1.平台情况 我是一个龙芯迷,最近在学生物信息,总想尝试一下用龙芯做生物信息的体验,新款的龙芯3A3000买不起。有龙芯吧友贡献了一台龙芯2F在线服务器,可以用来测试软件,刚好我的龙芯小本已挂。所以就用这哥们的机器测试一下,在此对这个 ...查看全部
1.平台情况

我是一个龙芯迷,最近在学生物信息,总想尝试一下用龙芯做生物信息的体验,新款的龙芯3A3000买不起。有龙芯吧友贡献了一台龙芯2F在线服务器,可以用来测试软件,刚好我的龙芯小本已挂。所以就用这哥们的机器测试一下,在此对这个哥们表示衷心地感谢!
#由图中可以看出,这台龙芯笔记本是8.9寸的小本,1g	内存
Linux debian 3.2.0-4-loongson-2f #1 Debian 3.2.51-1 mips64 GNU/Linux
total used free shared buffers cached

Mem: 1007 932 75 0 185 613

-/+ buffers/cache: 133 874

Swap: 391 0 391
system type : lemote-yeeloong-2f-8.9inches
processor : 0
cpu model : ICT Loongson-2 V0.3 FPU V0.1
BogoMIPS : 528.38
wait instruction : yes
microsecond timers : yes
tlb_entries : 64
由于十年前的产品,性能就不提了,至少是我们国家的自主产品。
2.FASTQC测试

当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc。

首先,fastqc是基于java的,所以,先安装java,好在龙芯已经移植了,很简单,下载,解压就行。
#java下载安装
wget http://ftp.loongnix.org/toolchain/java/openjdk6/jdk6-mips32-rc30.tar.gz
tar zxvf jdk6-mips32-rc30.tar.gz
#由于这台机器的环境变量搞不定,就直接路径运行了。
~/test/test-z/j2sdk-image/bin/java -version
java version "1.6.0-internal"
OpenJDK Runtime Environment (build 1.6.0-internal-loongson_14_nov_2016_08_24-b00)
OpenJDK Server VM (build 14.0-b16, mixed mode)
#fastqc下载解压
wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip #最新版本竟然ok
unzip fastqc_v0.11.5.zip
./fastqc
-bash: ./fastqc: 权限不够
chmod 777 fastqc
./fastqc
Can't exec "java": 没有那个文件或目录 at ./fastqc line 277. vi fastqc #把java路径改为~/test-z/j2sdk-image/bin/java ./fastqc -v FastQC v0.11.5 #可以了,搞定 ./fastqc ../../test-data/A_1.fastq ../../test-data/A_2.fastq Started analysis of A_1.fastq Approx 50% complete for A_1.fastq Approx 100% complete for A_1.fastq Analysis complete for A_1.fastq Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" Started analysis of A_2.fastq Approx 50% complete for A_2.fastq Approx 100% complete for A_2.fastq Analysis complete for A_2.fastq Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" #最后两行不清楚什么情况,有点小问题,不管了,至少还能用。看了一下结果,ok的,正常。
开心地看到了正确的质控结果图片!

3.picard

也是基于java的,试了一下,没有运行成功,龙芯3a应该是可以的,用jdk8发现运行不起来,这个测试不通过。
wget https://github.com/broadinstitute/picard/releases/download/2.13.2/picard.jar
#提示java太老了,需要更新,由于只是测试,好像jdk8
Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: picard/cmdline/PicardCommandLine : Unsupported major.minor version 52.0
4.gatk

也是基于java的,也只支持jdk1.8及以上版本。龙芯3a应该可以。

5.bwa-samtools

只提供x86版本二进制文件,所以难以搞定。

6.python
wget https://www.python.org/ftp/python/3.6.3/Python-3.6.3.tgz
tar zxvf Python-3.6.3.tgz
./configure
make #可以正常使用,R,perl也是如此。
综上,用龙芯做生物信息短期内来看还是不现实的,因为生物信息学领域许多软件只提供x86版本二进制文件,java、python、R和perl版的软件还是可以正常运行的。

龙芯小本 服务器快4年了,欢迎来做客

zzz19760225 回复了问题 • 3 人关注 • 3 个回复 • 585 次浏览 • 2017-10-11 10:12 • 来自相关话题

龙芯一体机想安装软件要怎么做?

zzz19760225 回复了问题 • 5 人关注 • 5 个回复 • 583 次浏览 • 2017-09-18 18:37 • 来自相关话题

买了台龙芯一体机,庆祝一下

STM64 发表了文章 • 3 个评论 • 404 次浏览 • 2017-09-15 16:30 • 来自相关话题

支持中国龙芯,买台玩玩,要是有人能教我怎么用这系统就好了,本来想用龙芯机子发帖的,然而不知道wifi网卡驱动如何安装,以及相关软件如何安装,目前暂时用windows系统的机子发帖,希望一个月后能熟练龙芯系统,用龙芯的机子发帖以及办公。
支持中国龙芯,买台玩玩,要是有人能教我怎么用这系统就好了,本来想用龙芯机子发帖的,然而不知道wifi网卡驱动如何安装,以及相关软件如何安装,目前暂时用windows系统的机子发帖,希望一个月后能熟练龙芯系统,用龙芯的机子发帖以及办公。
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loongnix

loongnix 回答了问题 • 2017-01-24 09:14 • 3 个回复 不感兴趣

龙芯3A3000笔记本怎样使用摄像头?

赞同来自:

芯3A3000笔记本自带一个摄像头,在屏幕下方。
使用方法:
[list]


[/list]
这个软件叫“茄子”,具有拍照片、录视频的功能。

还有各种奇趣特效,


是不是很牛! 显示全部 »
芯3A3000笔记本自带一个摄像头,在屏幕下方。
使用方法:
[list]


[/list]
这个软件叫“茄子”,具有拍照片、录视频的功能。

还有各种奇趣特效,


是不是很牛!

龙芯3A3000笔记本怎样使用摄像头?

fubaojun2006 回复了问题 • 2 人关注 • 3 个回复 • 734 次浏览 • 2017-01-25 11:30 • 来自相关话题

龙芯既然出了《龙芯应用开发标准教程》何不再出一本类似《intel 微控制器》的书?

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issacsonjj 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 54 次浏览 • 2018-12-17 16:01 • 来自相关话题

龙芯多核心CPU可以加入x86cpu的核心,实现linux系统与windows系统切换吗?

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jiangtao9999 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 222 次浏览 • 2018-07-11 10:55 • 来自相关话题

建议龙芯笔记本电脑建立全新的软硬件升级模式

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start0878 回复了问题 • 2 人关注 • 2 个回复 • 419 次浏览 • 2018-02-27 11:48 • 来自相关话题

请问我在哪里能下载到龙芯服务器历史版本?

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paul_lmc 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 293 次浏览 • 2018-01-02 16:48 • 来自相关话题

龙芯小本 服务器快4年了,欢迎来做客

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zzz19760225 回复了问题 • 3 人关注 • 3 个回复 • 585 次浏览 • 2017-10-11 10:12 • 来自相关话题

龙芯一体机想安装软件要怎么做?

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zzz19760225 回复了问题 • 5 人关注 • 5 个回复 • 583 次浏览 • 2017-09-18 18:37 • 来自相关话题

3A3000笔记本cpu主频的问题

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loongnix 回复了问题 • 2 人关注 • 2 个回复 • 656 次浏览 • 2017-03-27 17:14 • 来自相关话题

龙芯梦兰3A2000 mini-itx主板(LX-6102)能用什么散热器

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[已注销] 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 352 次浏览 • 2017-02-16 18:34 • 来自相关话题

深度商店不能安装啊,是不是服务器关了?

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fubaojun2006 回复了问题 • 2 人关注 • 3 个回复 • 571 次浏览 • 2017-01-25 15:28 • 来自相关话题

龙芯电脑推广民用难以一蹴而就,应向苹果学习支持windows双系统

liyongA06 发表了文章 • 5 个评论 • 165 次浏览 • 2018-12-03 09:06 • 来自相关话题

支持windows系统是龙芯电脑走向民用的必然过程,国产系统被民众接受不可能一蹴而就,苹果电脑如果不能支持windows买的人会少很多,多数用户都选择安装双系统。龙芯cpu只支持linux系统,应用生态不完善,所以很难民用。但是电脑可以采用龙芯cpu与x86核 ...查看全部
支持windows系统是龙芯电脑走向民用的必然过程,国产系统被民众接受不可能一蹴而就,苹果电脑如果不能支持windows买的人会少很多,多数用户都选择安装双系统。龙芯cpu只支持linux系统,应用生态不完善,所以很难民用。但是电脑可以采用龙芯cpu与x86核心cpu的组合实现windows系统支持或者是双系统支持,甚至在linux系统中直接安装使用windows系统的程序。双cpu协同工作也为大幅度提高电脑性能提供了可能性。两种不同指令集的cpu协同工作在技术上也许非常困难,是本小白的异想天开而已,但科技发展本就是从异想天开开始。

龙芯生物信息学软件应用测试

zd200572 发表了文章 • 6 个评论 • 405 次浏览 • 2017-10-20 13:20 • 来自相关话题

1.平台情况 我是一个龙芯迷,最近在学生物信息,总想尝试一下用龙芯做生物信息的体验,新款的龙芯3A3000买不起。有龙芯吧友贡献了一台龙芯2F在线服务器,可以用来测试软件,刚好我的龙芯小本已挂。所以就用这哥们的机器测试一下,在此对这个 ...查看全部
1.平台情况

我是一个龙芯迷,最近在学生物信息,总想尝试一下用龙芯做生物信息的体验,新款的龙芯3A3000买不起。有龙芯吧友贡献了一台龙芯2F在线服务器,可以用来测试软件,刚好我的龙芯小本已挂。所以就用这哥们的机器测试一下,在此对这个哥们表示衷心地感谢!
#由图中可以看出,这台龙芯笔记本是8.9寸的小本,1g	内存
Linux debian 3.2.0-4-loongson-2f #1 Debian 3.2.51-1 mips64 GNU/Linux
total used free shared buffers cached

Mem: 1007 932 75 0 185 613

-/+ buffers/cache: 133 874

Swap: 391 0 391
system type : lemote-yeeloong-2f-8.9inches
processor : 0
cpu model : ICT Loongson-2 V0.3 FPU V0.1
BogoMIPS : 528.38
wait instruction : yes
microsecond timers : yes
tlb_entries : 64
由于十年前的产品,性能就不提了,至少是我们国家的自主产品。
2.FASTQC测试

当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc。

首先,fastqc是基于java的,所以,先安装java,好在龙芯已经移植了,很简单,下载,解压就行。
#java下载安装
wget http://ftp.loongnix.org/toolchain/java/openjdk6/jdk6-mips32-rc30.tar.gz
tar zxvf jdk6-mips32-rc30.tar.gz
#由于这台机器的环境变量搞不定,就直接路径运行了。
~/test/test-z/j2sdk-image/bin/java -version
java version "1.6.0-internal"
OpenJDK Runtime Environment (build 1.6.0-internal-loongson_14_nov_2016_08_24-b00)
OpenJDK Server VM (build 14.0-b16, mixed mode)
#fastqc下载解压
wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip #最新版本竟然ok
unzip fastqc_v0.11.5.zip
./fastqc
-bash: ./fastqc: 权限不够
chmod 777 fastqc
./fastqc
Can't exec "java": 没有那个文件或目录 at ./fastqc line 277. vi fastqc #把java路径改为~/test-z/j2sdk-image/bin/java ./fastqc -v FastQC v0.11.5 #可以了,搞定 ./fastqc ../../test-data/A_1.fastq ../../test-data/A_2.fastq Started analysis of A_1.fastq Approx 50% complete for A_1.fastq Approx 100% complete for A_1.fastq Analysis complete for A_1.fastq Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" Started analysis of A_2.fastq Approx 50% complete for A_2.fastq Approx 100% complete for A_2.fastq Analysis complete for A_2.fastq Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" Default case invoked for: opcode = 84, "ConvL2F" #最后两行不清楚什么情况,有点小问题,不管了,至少还能用。看了一下结果,ok的,正常。
开心地看到了正确的质控结果图片!

3.picard

也是基于java的,试了一下,没有运行成功,龙芯3a应该是可以的,用jdk8发现运行不起来,这个测试不通过。
wget https://github.com/broadinstitute/picard/releases/download/2.13.2/picard.jar
#提示java太老了,需要更新,由于只是测试,好像jdk8
Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: picard/cmdline/PicardCommandLine : Unsupported major.minor version 52.0
4.gatk

也是基于java的,也只支持jdk1.8及以上版本。龙芯3a应该可以。

5.bwa-samtools

只提供x86版本二进制文件,所以难以搞定。

6.python
wget https://www.python.org/ftp/python/3.6.3/Python-3.6.3.tgz
tar zxvf Python-3.6.3.tgz
./configure
make #可以正常使用,R,perl也是如此。
综上,用龙芯做生物信息短期内来看还是不现实的,因为生物信息学领域许多软件只提供x86版本二进制文件,java、python、R和perl版的软件还是可以正常运行的。

买了台龙芯一体机,庆祝一下

STM64 发表了文章 • 3 个评论 • 404 次浏览 • 2017-09-15 16:30 • 来自相关话题

支持中国龙芯,买台玩玩,要是有人能教我怎么用这系统就好了,本来想用龙芯机子发帖的,然而不知道wifi网卡驱动如何安装,以及相关软件如何安装,目前暂时用windows系统的机子发帖,希望一个月后能熟练龙芯系统,用龙芯的机子发帖以及办公。
支持中国龙芯,买台玩玩,要是有人能教我怎么用这系统就好了,本来想用龙芯机子发帖的,然而不知道wifi网卡驱动如何安装,以及相关软件如何安装,目前暂时用windows系统的机子发帖,希望一个月后能熟练龙芯系统,用龙芯的机子发帖以及办公。